微生物扩增子测序

技术服务

NEORABIO

技术服务

通过基因工程手段定向设计和生产生物分子的技术
微生物扩增子检测(16S/ITS/18S)基于Illumina NovaSeq PE250测序平台,针对细菌16S rRNA V3-V4区、真菌ITS1/ITS2区、或真核微生物18S rRNA的高变区进行PCR扩增测序,解析微生物群落组成、多样性及系统发育关系。具有低成本、高灵敏度(可检测低至0.01%丰度的菌群)和广泛数据库支持的特点,适用于大样本队列的微生物生态研究。

服务流程

样本采集→ DNA提取与质检 → 靶向区域PCR扩增 → 文库构建 → 高通量测序 → 数据质控 → ASV聚类 → 物种注释 → α/β多样性分析 → 差异物种筛选 → 功能预测 → 报告交付

应用场景


肠道微生态与疾病研究
解析肠菌失衡与疾病(如IBD、糖尿病、自闭症)的关系,评估益生菌/抗生素干预后的菌群恢复效果。
与转录组、蛋白组、代谢组等组学联合分析,揭示生命体肠脑轴反馈方式,发现信号传导新机制。

环境微生物监测
土壤/水体修复:追踪污染物降解菌(如Pseudomonas)的动态变化,指导生物修复策略;分析根际微生物与作物抗病性(如水稻纹枯病)的关联。

工业流程优化 监控发酵过程(如酒曲、泡菜、酸奶)中的优势菌群(如Lactobacillus、Saccharomyces),优化工艺。

技术优势


高性价比:适合大规模样本筛查
高灵敏度:可检测稀有微生物,分辨率达属/种水平
生态分析完善:提供Shannon/Chao1指数、PCoA、LEfSe等分析,支持环境因子关联(RDA/CCA)

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